Après 9 années d’exil Meetra Surik revient dans l'espace Républicain. Meetra, coupée de la Force depuis Malachor, s'engage comme simple matelot à bord d'un vaisseau de la République, Le Harbinger.
Mais Atris trahi une nouvelle fois et rend publique les information concernant l'Exilée, ce qui permet a Sion de la repérer et d'attaquer le Harbringer.
Dans le même temps Dark Traya prends la fuite a bord de l'Ebon Hawk pour fuir Nihilus qui cherche a la tuer, a partir de cet instant elle se fera appeler Kreia.
Suite à cela toute deux se retrouvent dans le centre médical de Péragus, mais elles doivent prendre la fuite avec l'aide d'Atton Rand, car Sion a retrouvé leur traces.
Péragus est détruite mais comme a son habitude l'Ebon Hawk en échappe avec a son bord Kreia, Atton, Meetra, T3 et un étrange Droïde assassin en miette.
Meetra apprend a recreer un lien avec la Force grace a l'aide de Kreia et part en quete de réponses, elle tente donc de retrouver les maîtres Jedi survivant, Atris, Vrook, Kavar, Zez Kai Ell et Vash
Dans sa quête l'équipage de l'Ebon Hawk se completera avec Bao-Dur, Mical, Brihanna, HK-47 (le Droïde en morceau réparé), Visas Marr, Mira G0-T0 et Mandalore plus connu sous le nom de Canderous Ordo.
Meetra decouvrira la verité sur Atris et sera contrainte de la combattre puis avec l'aide des Mandaloriens de Canderous va même sauver Telos de l'attaque du terrible Dark Nihilus, ce dernier sera alors tué a la fin de la bataille et Visas partira avec le masque de son ancien maître.
Kreia profitera de la bataille de Telos pour partir sur Dantooine et tuer les Maîtres Jedi mettant ainsi fin a la purge Jedi et redevenant Dark Traya.
Meetra n'aura d'autre choix que de partir sur Malachor où elle brisera la volonté de Dark Sion et affrontera Dark Traya.
Traya vaincue, Bao-dur détruit définitivement la planète.
Mical, Atton, Brihanna, Mira et Visas seront les refondateur de l'Ordre Jedi, Meetra part alors à la recherche de Revan.
Dark Nihilus, le seigneur de la Faim.